农业技术中心前身为黑龙江农业现代化研究所，成立于1978年，2002年3月，原中国科学院长春地理研究所和原中国科学院黑龙江农业现代化研究所整合组建而成。知识创新工程给东北地理与农业生态研究所的发展提供了重要的历史契机，两所整合使新的研究所拓展了更为广阔的发展空间。农业技术中心现有在职职工99人，其中科技人员65人，科研支撑人员9人，管理人员与后勤服务人员25人。　 

2005年圆满完成中国科学院知识创新工程二期创新工作，通过科学院的考核评估，顺利进入中国科学院知识创新工程三期创新行列，经过近五十年的发展历程，几代科学家和广大职工的共同努力下，开创了以东北区域农业与生态研究为重点的中国湿地、农业生态、遥感信息技术等研究领域，谱写出了以“团结、务实、开拓、发展”为精神内涵的创新发展新篇章。　

现有博士后流动站1个，是博士、硕士研究生授予单位。2005年圆满完成中国科学院知识创新工程二期创新工作，通过科学院的考核评估，顺利进入中国科学院知识创新工程三期创新行列。　 

中国科学院实施知识创新工程重大改革以来，为东北地理所的发展注入了新的活力。全所科技创新能力逐步提升，在湿地生态、区域农业、地理与遥感信息技术等领域，取得了一批又一批有显示度的科研成果，充分展示了我所在以区域农业和湿地生态综合性研究成果服务地方经济方面的深厚实力。