农业技术中心主要任务是围绕国家粮食安全和生态安全的重大战略需求，面向国际科技前沿，形成了基于地表系统过程的农业生态学自主创新体系。重点开展黑土农田地力提升及其关键技术，阐明了黑土演化过程与驱动机制，揭示了黑土退化特征和肥力调控机理；研发了侵蚀黑土综合防治技术，建立了以“秸秆和有机肥深混还田”为关键技术，辅以玉米-大豆轮作黑土地保护利用的“龙江模式”。在水稻分子育种方面，鉴定了多个水稻重要农艺性状的关键基因并解析了分子机制，建立了以基因编辑为基础的水稻分子设计育种平台。在大豆分子育种方面，首次克隆了控制大豆开花期的最大位点基因E1以及控制大豆长青春期性状的经典基因J，揭示大豆光周期反应的本质，阐明了大豆适应高纬度与低纬度的不同分子机理。同时开展了大豆常规育种与分子设计育种，育成“东生”系列大豆新品种18个，其中“东生3号”、“东生6号”、“东生9号”、“东生10号”是我所自主育成的丰产型国审大豆新品种，16个“东生”系列大豆品种已获得市场转化，品种转让金额超过2000万元。近年来，获国家、省部委奖项22项，其中国家科技进步二等奖3项、省部级一等奖8项，二等奖10项；发表SCI学术论文337篇，发表CSCD学术论文456篇，其中在Science、Nature Genetics、PNAS、Plant Cell等国际著名学术刊物上发表有关中国粮食需求解决途径与挑战、大豆光周期调控开花研究、水稻抽穗期和抗逆基因功能解析等成果；申请发明专利229项，授权专利89项，其中发明专利72项。